Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms