Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC171Q6TFL3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms