Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms