Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L2Q6R6M4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L2Q6R6M4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L2Q6R6M4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L2Q6R6M4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L2Q6R6M4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L2Q6R6M4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L2Q6R6M4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L2Q6R6M4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L2Q6R6M4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L2Q6R6M4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L2Q6R6M4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L2Q6R6M4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L2Q6R6M4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L2Q6R6M4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L2Q6R6M4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L2Q6R6M4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP17L2Q6R6M4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
USP17L2Q6R6M4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L2Q6R6M4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms