Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED9Q6R2W3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms