Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A47Q6Q0C1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms