Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF544Q6NX49 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms