Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT39Q6A163 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT39Q6A163 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms