Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RNF123Q5XPI4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms