Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms