Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR78Q5VTH9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms