Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms