Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC30■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RSPH4AQ5TD94 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RSPH4AQ5TD94 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RSPH4AQ5TD94 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RSPH4AQ5TD94 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RSPH4AQ5TD94 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RSPH4AQ5TD94 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RSPH4AQ5TD94 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RSPH4AQ5TD94 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RSPH4AQ5TD94 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RSPH4AQ5TD94 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RSPH4AQ5TD94 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RSPH4AQ5TD94 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RSPH4AQ5TD94 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RSPH4AQ5TD94 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms