Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms