Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms