Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFTN2Q52LD8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms