Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM259Q4ZIN3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM259Q4ZIN3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms