Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VWC2Q2TAL6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms