Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIDA1Q1XH10 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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