Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q1T7F1 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q1T7F1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q1T7F1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q1T7F1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q1T7F1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q1T7F1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q1T7F1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q1T7F1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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