Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL24A1Q17RW2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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