Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC142Q17RM4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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