Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
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