Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKN3Q16667 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms