Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms