Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM1Q16610 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM1Q16610 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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