Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCSK7Q16549 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms