Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITSN1Q15811 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms