Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRIP13Q15645 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIP13Q15645 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms