Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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TAF1AQ15573 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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