Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIX1Q15475 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIX1Q15475 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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