Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 GAK-215ENST00000511229 568 ntTSL 35.73□□□□□ -1.498e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.528e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 AC099329.1-201ENST00000625589 539 ntTSL 55.15□□□□□ -1.598e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.698e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 RAB8A-207ENST00000592971 300 ntTSL 20.56□□□□□ -2.328e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ATP5G1-208ENST00000513781 759 ntTSL 313.24□□□□□ -0.292e-20■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ATP5G1-210ENST00000515060 433 ntTSL 312.67□□□□□ -0.382e-20■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ATP5G1-201ENST00000355938 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.712e-20■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ATP5G1-204ENST00000503641 539 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.722e-20■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ATP5G1-206ENST00000506855 468 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.822e-20■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ATP5G1-203ENST00000502964 679 ntTSL 29.65□□□□□ -0.862e-20■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ATP5G1-202ENST00000393366 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.92e-20■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ATP5G1-207ENST00000513347 2214 ntTSL 29.16□□□□□ -0.942e-20■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.012e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.962e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ST3GAL4-214ENST00000531217 1745 ntTSL 520.39■□□□□ 0.852e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.782e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.692e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ST3GAL4-220ENST00000534733 545 ntTSL 517.06■□□□□ 0.322e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 RRP1-202ENST00000471909 2544 ntTSL 1 (best)17.07■□□□□ 0.322e-9■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.072e-9■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 RRP1-201ENST00000467112 3019 ntTSL 1 (best)14.65□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.523e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 COMMD10-204ENST00000507356 870 ntTSL 311.43□□□□□ -0.583e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.63e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.423e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 COMMD10-203ENST00000506589 793 ntTSL 53.74□□□□□ -1.813e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 EEA1-205ENST00000553019 558 ntTSL 518.21■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 EEA1-203ENST00000547833 661 ntTSL 318.03■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 PRKAR1B-206ENST00000417852 651 ntTSL 218.25■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 SLC26A6-217ENST00000480524 2727 ntTSL 1 (best)12.27□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.438e-7■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 DDR1-223ENST00000324771 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.558e-7■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 DDR1-227ENST00000376570 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.578e-7■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 DDR1-232ENST00000418800 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.628e-7■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 DDR1-240ENST00000454612 3942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.668e-7■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 ABCC6-202ENST00000456970 4137 ntTSL 213.45□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 32.5
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PCBP2Q15366 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.256e-7■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.256e-7■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 NUP50-218ENST00000493456 478 ntTSL 316.26■□□□□ 0.196e-7■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.136e-7■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 NUP50-214ENST00000469163 3507 ntTSL 29.26□□□□□ -0.936e-7■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 NUP50-206ENST00000422489 543 ntTSL 38.63□□□□□ -1.036e-7■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 CSNK1D-221ENST00000582844 957 ntTSL 519.78■□□□□ 0.768e-9■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 CSNK1D-207ENST00000578194 567 ntTSL 412.08□□□□□ -0.488e-9■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.473e-7■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 SREBF1-204ENST00000395756 3026 ntTSL 217.54■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.732e-13■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 ATP2C1-217ENST00000509662 559 ntTSL 422.49■■□□□ 1.192e-8■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 ATP2C1-204ENST00000428331 4795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.722e-8■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.422e-8■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 UHRF2-203ENST00000450508 474 ntTSL 33.7□□□□□ -1.822e-8■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.892e-8■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 RERE-218ENST00000514428 273 ntTSL 32.76□□□□□ -1.973e-9■■■■■ 32.5
PCBP2Q15366 AP1G1-215ENST00000568327 1724 ntTSL 518.35■□□□□ 0.531e-8■■■■■ 32.4
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PCBP2Q15366 AP1G1-206ENST00000563259 844 ntTSL 415.7■□□□□ 0.11e-8■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 AP1G1-208ENST00000565009 2494 ntTSL 513.48□□□□□ -0.251e-8■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 AP1G1-217ENST00000569185 559 ntTSL 312.14□□□□□ -0.471e-8■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.51e-8■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 AP1G1-212ENST00000566161 989 ntTSL 411.18□□□□□ -0.621e-8■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 AP1G1-202ENST00000393512 3593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.891e-8■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.171e-8■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 AP1G1-203ENST00000450149 1166 ntTSL 27.14□□□□□ -1.271e-8■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.097e-7■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.543e-11■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.26■■□□□ 1.313e-11■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.17e-7■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.53e-7■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.413e-7■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.363e-7■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 STXBP2-211ENST00000597068 1785 ntTSL 1 (best)14.39□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 STXBP2-217ENST00000599737 1523 ntTSL 514.11□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.299e-9■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 MLXIP-209ENST00000539861 1384 ntTSL 1 (best)11.76□□□□□ -0.539e-9■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 MLXIP-207ENST00000538061 1078 ntTSL 37.7□□□□□ -1.189e-9■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.359e-9■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 GDI1-208ENST00000471972 534 ntTSL 210.73□□□□□ -0.691e-12■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 TMED10-203ENST00000555085 553 ntTSL 212.57□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 TMED10-204ENST00000555873 1161 ntTSL 1 (best)12.57□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 RGS3-219ENST00000478599 4211 ntTSL 211.96□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 RGS3-207ENST00000374140 4591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.732e-7■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 METTL25-203ENST00000547985 558 ntTSL 419.72■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 PXDC1-203ENST00000477592 1697 ntTSL 517.04■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 SOD2-209ENST00000535561 551 ntTSL 313.95□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 METTL25-204ENST00000548200 743 ntTSL 1 (best)12.96□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 METTL25-206ENST00000548569 563 ntTSL 412.42□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 32.4
PCBP2Q15366 SOD2-204ENST00000401980 523 ntTSL 412.3□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 32.4
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