Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF1Q15361 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
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