Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKX1-1Q15270 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
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