Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms