Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 SMPD4-208ENST00000439029 566 ntTSL 48.79□□□□□ -11e-6■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 XAB2-203ENST00000596134 543 ntTSL 216.72■□□□□ 0.274e-9■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 XAB2-204ENST00000600230 749 ntTSL 316.72■□□□□ 0.274e-9■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 GGA1-216ENST00000460957 790 ntTSL 215.18■□□□□ 0.024e-9■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.114e-9■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 NUP160-206ENST00000528071 4138 ntTSL 510.81□□□□□ -0.684e-9■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 NTAN1-205ENST00000566542 2398 ntTSL 27.33□□□□□ -1.244e-9■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 NTAN1-209ENST00000568738 439 ntTSL 26.81□□□□□ -1.324e-9■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 NUP160-209ENST00000530326 4811 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.34□□□□□ -1.394e-9■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6□□□□□ -1.454e-9■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 CLK3-219ENST00000567805 327 ntTSL 34.49□□□□□ -1.694e-9■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.439e-7■■■■■ 38.7
EFTUD2Q15029 MINK1-209ENST00000574453 4941 ntTSL 1 (best)16.95■□□□□ 0.39e-7■■■■■ 38.7
EFTUD2Q15029 MINK1-207ENST00000572330 5299 ntTSL 516.71■□□□□ 0.279e-7■■■■■ 38.7
EFTUD2Q15029 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.159e-7■■■■■ 38.7
EFTUD2Q15029 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.339e-7■■■■■ 38.7
EFTUD2Q15029 LRP1-208ENST00000555124 550 ntTSL 414.35□□□□□ -0.115e-7■■■■■ 38.7
EFTUD2Q15029 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.573e-7■■■■■ 38.7
EFTUD2Q15029 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.453e-7■■■■■ 38.7
EFTUD2Q15029 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.43e-7■■■■■ 38.7
EFTUD2Q15029 STXBP2-211ENST00000597068 1785 ntTSL 1 (best)14.62□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 38.7
EFTUD2Q15029 SAFB2-204ENST00000589925 506 ntTSL 316.03■□□□□ 0.163e-8■■■■■ 38.7
EFTUD2Q15029 CAPN15-205ENST00000567216 3174 ntTSL 1 (best)20.94■□□□□ 0.941e-6■■■■■ 38.7
EFTUD2Q15029 EDC4-204ENST00000572221 5267 ntTSL 221.78■■□□□ 1.088e-8■■■■■ 38.7
EFTUD2Q15029 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.068e-8■■■■■ 38.7
EFTUD2Q15029 EDC4-207ENST00000573992 3934 ntTSL 1 (best)11.95□□□□□ -0.58e-8■■■■■ 38.7
EFTUD2Q15029 TRAF4-206ENST00000454852 672 ntTSL 311.13□□□□□ -0.635e-12■■■■■ 38.7
EFTUD2Q15029 SZT2-209ENST00000562955 13968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.567e-7■■■■■ 38.7
EFTUD2Q15029 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.917e-7■■■■■ 38.7
EFTUD2Q15029 RNF31-203ENST00000491351 1804 ntTSL 525.07■■□□□ 1.65e-7■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.385e-7■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 RNF31-224ENST00000560787 2834 ntTSL 212.71□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 RNF31-211ENST00000559275 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.635e-7■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 ZNF337-203ENST00000481610 572 ntTSL 38.01□□□□□ -1.132e-8■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.22e-8■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.354e-8■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 RACK1-203ENST00000502844 1460 ntTSL 315.34■□□□□ 0.052e-22■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.714e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.594e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.584e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.424e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.384e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.384e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.384e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.384e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.384e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.384e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.384e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.384e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.384e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-220ENST00000519767 970 ntTSL 1 (best)23.66■■□□□ 1.384e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.034e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.64e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.434e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.424e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.374e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.414e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.484e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.554e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.554e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.554e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 SNX22-205ENST00000560945 1807 ntTSL 1 (best)22.66■■□□□ 1.229e-7■■■■■ 38.6
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EFTUD2Q15029 SNX22-207ENST00000561334 2789 ntTSL 216.91■□□□□ 0.39e-7■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 SNX22-204ENST00000560607 1182 ntTSL 216.28■□□□□ 0.29e-7■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 SNX22-202ENST00000557789 3713 ntTSL 513.82□□□□□ -0.29e-7■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.29e-7■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 CCNL1-211ENST00000468977 793 ntTSL 53.66□□□□□ -1.822e-17■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 UNC45A-208ENST00000495068 564 ntTSL 215.31■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 UBE2C-207ENST00000496085 518 ntTSL 312.65□□□□□ -0.387e-7■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 ATP6V0A1-212ENST00000587375 546 ntTSL 47.82□□□□□ -1.162e-9■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 ATP6V0A1-224ENST00000592324 585 ntTSL 46.72□□□□□ -1.332e-9■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 ATP6V0A1-208ENST00000586001 587 ntTSL 36.13□□□□□ -1.432e-9■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 ATP6V0A1-222ENST00000589727 664 ntTSL 55.85□□□□□ -1.472e-9■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 HNRNPU-212ENST00000638230 1922 ntTSL 512.92□□□□□ -0.347e-14■■■■■ 38.6
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EFTUD2Q15029 EZH1-205ENST00000585893 2394 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.792e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 EZH1-211ENST00000586867 1031 ntTSL 59.55□□□□□ -0.889e-7■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 EZH1-215ENST00000588897 2283 ntTSL 29.01□□□□□ -0.972e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 EZH1-208ENST00000586103 2752 ntTSL 58.76□□□□□ -1.012e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 EZH1-206ENST00000585912 2295 ntTSL 1 (best)8.67□□□□□ -1.022e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 EZH1-220ENST00000591330 2387 ntTSL 1 (best)8.46□□□□□ -1.062e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 EZH1-201ENST00000415827 4608 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.142e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.232e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.252e-10■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 EZH1-209ENST00000586382 1022 ntTSL 1 (best)6.85□□□□□ -1.319e-7■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 EZH1-218ENST00000590082 565 ntTSL 55.4□□□□□ -1.549e-7■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 EZH1-207ENST00000586089 559 ntTSL 55.3□□□□□ -1.569e-7■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 EZH1-221ENST00000592492 535 ntTSL 54.39□□□□□ -1.719e-7■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 EZH1-224ENST00000593214 745 ntTSL 53.5□□□□□ -1.859e-7■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.823e-6■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 LSM12-203ENST00000590563 559 ntTSL 211.96□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 38.6
EFTUD2Q15029 IL17RC-213ENST00000451231 2163 ntTSL 222.67■■□□□ 1.223e-7■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 IL17RC-214ENST00000451271 2284 ntTSL 1 (best)21.27■■□□□ 13e-7■■■■■ 38.5
EFTUD2Q15029 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.993e-7■■■■■ 38.5
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