Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 NUTM2B-AS1-204ENST00000483080 864 ntTSL 218.24■□□□□ 0.511e-11■□□□□ 11
PUM1Q14671 NUTM2B-AS1-207ENST00000495430 829 ntTSL 516.32■□□□□ 0.21e-11■□□□□ 11
PUM1Q14671 NUTM2B-AS1-208ENST00000496359 581 ntTSL 315.56■□□□□ 0.081e-11■□□□□ 11
PUM1Q14671 ACTR2-203ENST00000471552 554 ntTSL 414.76□□□□□ -0.051e-11■□□□□ 11
PUM1Q14671 ACTR2-204ENST00000476840 587 ntTSL 414.42□□□□□ -0.11e-11■□□□□ 11
PUM1Q14671 NUTM2B-AS1-206ENST00000488805 463 ntTSL 313.93□□□□□ -0.181e-11■□□□□ 11
PUM1Q14671 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.361e-11■□□□□ 11
PUM1Q14671 EFTUD2-202ENST00000426333 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.695e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 ACTR2-201ENST00000260641 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.991e-11■□□□□ 11
PUM1Q14671 EFTUD2-201ENST00000402521 3045 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.025e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 EFTUD2-223ENST00000592576 3364 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.045e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.245e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 EFTUD2-211ENST00000588374 524 ntTSL 36.83□□□□□ -1.325e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.711e-11■□□□□ 11
PUM1Q14671 C21orf59-206ENST00000440966 1082 ntTSL 319.66■□□□□ 0.744e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 C21orf59-202ENST00000300260 1243 ntTSL 217.98■□□□□ 0.474e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.294e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.284e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.324e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 AP000275.2-201ENST00000431216 891 ntAPPRIS P1 TSL 510.45□□□□□ -0.744e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.511e-7■□□□□ 11
PUM1Q14671 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.224e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.033e-13■□□□□ 11
PUM1Q14671 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.93e-13■□□□□ 11
PUM1Q14671 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.523e-13■□□□□ 11
PUM1Q14671 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.393e-13■□□□□ 11
PUM1Q14671 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.562e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.592e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.832e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 RPL5-201ENST00000315741 681 ntTSL 516.18■□□□□ 0.187e-25■□□□□ 11
PUM1Q14671 RPL5-203ENST00000461952 1116 ntTSL 27.6□□□□□ -1.197e-25■□□□□ 11
PUM1Q14671 RPL5-204ENST00000470843 694 ntTSL 34.32□□□□□ -1.727e-25■□□□□ 11
PUM1Q14671 GSE1-208ENST00000471070 555 ntTSL 39.21□□□□□ -0.945e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 VIM-204ENST00000478746 757 ntTSL 219.33■□□□□ 0.685e-14■□□□□ 11
PUM1Q14671 VIM-208ENST00000497849 634 ntTSL 218.78■□□□□ 0.65e-14■□□□□ 11
PUM1Q14671 VIM-205ENST00000485947 1139 ntTSL 217.69■□□□□ 0.425e-14■□□□□ 11
PUM1Q14671 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.291e-6■□□□□ 11
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PUM1Q14671 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.371e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 AP1B1-207ENST00000421126 1908 ntTSL 511.9□□□□□ -0.51e-6■□□□□ 11
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PUM1Q14671 AP1B1-205ENST00000415447 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.731e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 AP1B1-204ENST00000405198 3838 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.751e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 EIF4A1-222ENST00000582050 576 ntTSL 517.1■□□□□ 0.332e-7■□□□□ 11
PUM1Q14671 BRD4-205ENST00000594841 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.28□□□□□ -0.128e-11■□□□□ 11
PUM1Q14671 PSTPIP2-203ENST00000588801 1023 ntTSL 518.21■□□□□ 0.514e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 PSTPIP2-201ENST00000409746 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.664e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 PSTPIP2-204ENST00000589328 2900 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.744e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 RPL23-210ENST00000584583 429 ntTSL 28.71□□□□□ -1.027e-32■□□□□ 11
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PUM1Q14671 SRRM2-208ENST00000571378 2870 ntTSL 1 (best)13.94□□□□□ -0.182e-7■□□□□ 11
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PUM1Q14671 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.181e-7■□□□□ 11
PUM1Q14671 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.831e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 ATP5A1-213ENST00000590406 756 ntTSL 320.42■□□□□ 0.863e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 EIF4A1-216ENST00000580888 710 ntTSL 218■□□□□ 0.473e-8■□□□□ 11
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PUM1Q14671 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.013e-8■□□□□ 11
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PUM1Q14671 AC005726.2-202ENST00000531839 1033 ntAPPRIS P5 TSL 210.92□□□□□ -0.664e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 EIF4A1-223ENST00000582169 552 ntTSL 410.55□□□□□ -0.723e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 ATP5A1-212ENST00000590324 807 ntTSL 510.54□□□□□ -0.723e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 ATP5A1-219ENST00000592989 553 ntTSL 510.52□□□□□ -0.733e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 SPAG5-206ENST00000578479 904 ntTSL 310.34□□□□□ -0.754e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 SPAG5-210ENST00000580567 899 ntTSL 310.34□□□□□ -0.754e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 EIF4A1-229ENST00000583802 563 ntTSL 410.21□□□□□ -0.773e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 ATP5A1-209ENST00000589611 995 ntTSL 29.48□□□□□ -0.893e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 HMMR-201ENST00000353866 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.893e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 RERE-213ENST00000480342 2710 ntTSL 29.44□□□□□ -0.92e-11■□□□□ 11
PUM1Q14671 EIF4A1-217ENST00000581384 642 ntTSL 59.43□□□□□ -0.93e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 EIF4A1-237ENST00000585024 577 ntTSL 49.43□□□□□ -0.93e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 EIF4A1-230ENST00000583899 665 ntTSL 36.4□□□□□ -1.383e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 KIF5B-202ENST00000493889 494 ntTSL 26.25□□□□□ -1.413e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.423e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.463e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 UTP6-205ENST00000490218 807 ntTSL 55.92□□□□□ -1.467e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.533e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 CHD2-214ENST00000628181 545 ntTSL 55.38□□□□□ -1.554e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.755e-7■□□□□ 11
PUM1Q14671 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.545e-7■□□□□ 11
PUM1Q14671 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.145e-7■□□□□ 11
PUM1Q14671 PSMD8-203ENST00000590331 422 ntTSL 27.68□□□□□ -1.185e-7■□□□□ 11
PUM1Q14671 RHOT2-225ENST00000570092 674 ntTSL 325.58■■□□□ 1.692e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 RHOT2-207ENST00000562708 672 ntTSL 524.97■■□□□ 1.592e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.021e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.141e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.181e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.541e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 GLUL-207ENST00000463851 939 ntTSL 310.02□□□□□ -0.811e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 GLUL-212ENST00000491322 6132 ntTSL 1 (best)9.52□□□□□ -0.881e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 PTBP1-212ENST00000587136 583 ntTSL 321.4■■□□□ 1.029e-10■□□□□ 11
PUM1Q14671 PTBP1-208ENST00000585956 767 ntTSL 321.35■■□□□ 1.019e-10■□□□□ 11
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