Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCARF1Q14162 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARF1Q14162 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
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