Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA7Q13683 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA7Q13683 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA7Q13683 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA7Q13683 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA7Q13683 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA7Q13683 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA7Q13683 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA7Q13683 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA7Q13683 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA7Q13683 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA7Q13683 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA7Q13683 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA7Q13683 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA7Q13683 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA7Q13683 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA7Q13683 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA7Q13683 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA7Q13683 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA7Q13683 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA7Q13683 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA7Q13683 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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