Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTCH1Q13635 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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