Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4BQ13620 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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