Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL3Q13618 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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