Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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TUBB3Q13509 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBB3Q13509 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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