Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
XRCC4Q13426 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
XRCC4Q13426 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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