Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTA1Q13424 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms