Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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SKP2Q13309 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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SKP2Q13309 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKP2Q13309 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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