Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.171e-7■■■■□ 22.9
TARDBPQ13148 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.051e-7■■■■□ 22.9
TARDBPQ13148 FAM172A-201ENST00000395965 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.811e-7■■■■□ 22.9
TARDBPQ13148 FAM172A-202ENST00000502503 1392 ntTSL 29.54□□□□□ -0.881e-7■■■■□ 22.9
TARDBPQ13148 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.776e-7■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 SLC25A37-201ENST00000290075 1889 ntTSL 1 (best)19.63■□□□□ 0.731e-7■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 SLC25A37-202ENST00000417331 735 ntTSL 519.61■□□□□ 0.731e-7■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 SLC25A37-212ENST00000523930 823 ntTSL 514.18□□□□□ -0.141e-7■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 SLC25A37-204ENST00000518881 3404 ntTSL 1 (best)13.52□□□□□ -0.241e-7■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 LINC01194-203ENST00000513051 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.432e-7■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 LINC01194-201ENST00000505196 540 ntTSL 1 (best)12.39□□□□□ -0.432e-7■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 AARS-201ENST00000261772 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.621e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.876e-8■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 WHRN-204ENST00000374059 3278 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.712e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 CEP135-201ENST00000257287 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 CEP135-203ENST00000506202 5129 ntTSL 1 (best)7.82□□□□□ -1.162e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 ZC3H7A-211ENST00000574995 532 ntTSL 425.96■■□□□ 1.752e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 ZC3H7A-208ENST00000572781 564 ntTSL 416.12■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 ZC3H7A-216ENST00000576018 575 ntTSL 415.43■□□□□ 0.062e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 ZC3H7A-213ENST00000575170 831 ntTSL 315.31■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 ZC3H7A-205ENST00000571198 2343 ntTSL 214.77□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 ZC3H7A-201ENST00000355758 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.872e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.011e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 ZFP91-CNTF-202ENST00000422974 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.62□□□□□ -0.711e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 SETD5-211ENST00000443339 3478 ntTSL 210.12□□□□□ -0.794e-7■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.132e-7■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.162e-7■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.372e-7■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 ZNF124-205ENST00000491848 701 ntTSL 312.18□□□□□ -0.462e-7■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 ZNF124-201ENST00000340684 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.492e-7■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.516e-7■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.72e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.062e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 ZNF800-202ENST00000393312 2375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.562e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 ZNF800-204ENST00000434602 955 ntTSL 511.25□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 ZNF800-206ENST00000439506 410 ntTSL 1 (best)8.49□□□□□ -1.052e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 ZNF800-205ENST00000436992 502 ntTSL 22.75□□□□□ -1.972e-6■■■■□ 22.8
TARDBPQ13148 PHKB-209ENST00000566275 1375 ntTSL 36.92□□□□□ -1.32e-11■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 SUPT3H-205ENST00000475057 1377 ntTSL 27.07□□□□□ -1.281e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.371e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 SUPT3H-204ENST00000459689 396 ntTSL 26.12□□□□□ -1.431e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.541e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.426e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.476e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.326e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.266e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.076e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 UBAC2-201ENST00000355700 748 ntTSL 316.94■□□□□ 0.31e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 UBAC2-209ENST00000474510 853 ntTSL 216.49■□□□□ 0.231e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.041e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 UBAC2-211ENST00000494576 1855 ntTSL 213.79□□□□□ -0.21e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 UBAC2-205ENST00000460562 2350 ntTSL 213.37□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 UBAC2-208ENST00000473194 861 ntTSL 1 (best)8.91□□□□□ -0.981e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 UBAC2-210ENST00000480738 1017 ntTSL 1 (best)8.67□□□□□ -1.021e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 HECTD4-212ENST00000550724 587 ntTSL 314.54□□□□□ -0.083e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.239e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.179e-10■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.099e-10■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.29e-10■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ASPH-205ENST00000445642 3717 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.499e-10■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ASPH-203ENST00000379454 5268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.59e-10■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ASPH-208ENST00000517856 6337 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.539e-10■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ASPH-201ENST00000356457 3730 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.639e-10■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ASPH-225ENST00000522835 1258 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.949e-10■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ASPH-230ENST00000541428 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.029e-10■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ASPH-206ENST00000517661 809 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.079e-10■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.099e-10■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ASPH-207ENST00000517847 1947 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.129e-10■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ASPH-204ENST00000389204 1290 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.219e-10■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ASPH-212ENST00000518306 755 ntTSL 57.33□□□□□ -1.249e-10■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ASPH-223ENST00000522349 531 ntTSL 56.36□□□□□ -1.399e-10■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ASPH-228ENST00000523927 556 ntTSL 45.58□□□□□ -1.529e-10■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ASPH-210ENST00000517928 548 ntTSL 45.47□□□□□ -1.539e-10■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.579e-10■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.441e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ELOVL6-204ENST00000506461 575 ntTSL 49.33□□□□□ -0.921e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ELOVL6-205ENST00000506625 610 ntTSL 49.14□□□□□ -0.951e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.481e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ELOVL6-203ENST00000503885 458 ntTSL 45.58□□□□□ -1.521e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ELOVL6-208ENST00000514184 607 ntTSL 34.79□□□□□ -1.641e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.535e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.535e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.515e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 KCTD15-204ENST00000587658 632 ntTSL 323.92■■□□□ 1.425e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 EMC10-207ENST00000599293 1926 ntTSL 323.57■■□□□ 1.365e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.345e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 MAPRE2-213ENST00000591734 803 ntTSL 222.89■■□□□ 1.255e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.245e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ANTXR2-207ENST00000491345 557 ntTSL 422.6■■□□□ 1.215e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 EMC10-208ENST00000601780 2178 ntTSL 1 (best)22.39■■□□□ 1.175e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 SLC38A1-207ENST00000549633 1076 ntTSL 1 (best)21.82■■□□□ 1.086e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 PDK1-205ENST00000431718 728 ntTSL 321.29■■□□□ 15e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.975e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 CEP350-210ENST00000491495 1059 ntTSL 520.34■□□□□ 0.855e-7■■■■□ 22.7
Retrieved 100 of 14,326 protein–RNA pairs in 162.4 ms