Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPS1Q13098 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPS1Q13098 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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