Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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FOXF1Q12946 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXF1Q12946 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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