Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP160Q12769 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP160Q12769 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP160Q12769 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP160Q12769 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP160Q12769 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP160Q12769 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP160Q12769 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP160Q12769 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP160Q12769 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP160Q12769 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP160Q12769 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP160Q12769 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUP160Q12769 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NUP160Q12769 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
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